SNP-index图是BSA分析文章的标配,呈现所有双亲间多态的SNP位点对应的SNP-index在全基因组水平的变化。我们通过计算子代SNP index,及其差值ΔSNP index,绘制染色体分布图,并提供各染色体分布图,使结果更清楚明确。 [好文分享:www.11jj.com]
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图3 ΔSNP index总分布图
图4 ΔSNP index各染色体分布图
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候选区域定位
对候选区域内的SNP进行注释的同时,也会对候选区域内的InDel进行注释,帮助定位到某些由片段插入缺失所引起的性状改变。
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