藏鸡驯化的多起源和适应性进化(5)

受选择区域一般表现较高的群体分化、较低的核苷酸多样性和较长的纯合单倍型。 [原文来自：www.11jj.com]

第一组藏鸡鉴定到203个候选基因，基因富集分析发现可能参与高海拔适应的基因显著富集。

在候选基因中，四个基因参与“reactive oxygen species (ROS) metabolic process”，另外四个基因则在 “abnormality of calcium homeostasis”中富集。低氧会引起肺细胞中细胞内ROS浓度的显着增加，因此ROS导致Ca2+在细胞内浓度的大量增加，ROS和Ca2+都是调节缺氧反应的重要信号分子。

第二组藏鸡鉴定到176个候选基因，富集了许多与人类心脏和肺部疾病相关的基因，它们可能在藏鸡中有助于心脏和肺的适应性发育，允许藏鸡在高海拔环境中生存。另外，FST值极高（0.01％）的区域只发现一个蛋白质编码基因RYR2。缺氧通常会导致由RYR2介导的细胞内Ca2+的释放，从而导致细胞收缩增加， RYR2是钙离子通道的一个重要组成部分。

 

图4 藏鸡中的选择信号

两组藏鸡中鉴定的候选基因中只有七个基因重叠，这些基因与高原适应性的潜在功能尚不清楚。第一组藏鸡在基因区具有更多的受选择SNP，而第二组藏鸡在UTR区具有更多的受选择SNP，表明两组藏鸡在高原适应性方面具有各自独立的分子机制。

 

藏鸡的选择性清除分析得到363个候选基因。其中“钙信号途径”的基因显著富集。长距离的单倍型纯合性分析鉴定到193个基因，“钙信号途径”也显著富集，这表明钙信号途径是藏鸡适应缺氧的高原环境中受选择的重要目标。

 总  结